シロイヌナズナのゲノム上の遺伝子の約5.9%が転写因子の遺伝子 であると推定されており、また、シロイヌナズナの転写因子の約45%が酵母や動物には見つからない植物 特異的な転写因子であると考えられています。このような植物特異的な転写因子は植物が動物や酵母と進化 の過程で分岐した後に生じと考えられ、植物に固有の機能の制御や植物に特異的なシグナル応答機構に関 わっていると予測されます。 　
　私たちは、トウモロコシより植物に特異的なタイプの転写因子ファミリーの一つを発見して、Dof転写 因子群と命名しました（J. Biol. Chem. 268：16028-16036, 1993; Nucleic Acid Res. 23:3403-3410, 1995; Trends Plant Sci. 1:213-214, 1996）。Dof転写因子は、C2-C2タイプのZinc-fingerを形成する極めて相同性の高いDNA結合ドメイン（Dofドメイン）を持ち、 5'-AAAG-3'または5'-CTTT-3' という配列を認識して、そこに結合します。Dof転写因子は、トウモロコシ以外にも様々な植物種に存在していることが確認されており、例えば、モデル植物 であるシロイヌナズナには36個のDof転写因子が、イネにも30個以上のDof転写因子が存在してい ます(Trends Plant Sci. 7:555-560, 2002; Plant Cell Physiol. 45:386-391, 2004; Chapter 12 in Plant Transcription Factors, 2015)。植物界に広く存在しているDof転写因子群は光合成遺伝子の発現、種子貯蔵タンパク質遺伝子の発現、ホルモン応答、孔辺細胞の機能化過程、維 管束形成などに関わっていることが判明しており、Dof転写因子は植物に固有の生命現象に深く関わって いると推定されます。しかしながら、まだ多くのDof転写因子の生理的役割は不明です。個々のDof転 写因子の生理的役割及びDof転写因子群の誕生と植物機能の制御の高度化との関係ついて、様々な解析手 段を用いて解析しています。例えば、シロイヌナズナにおいて、Dof2.1はジャスモン酸応答に関与し ていること（Plant Cell 32:242-262, 2020）やDof1.7は窒素欠乏応答を強化する役割を担っていること（New Phytol. 242:2132-2147, 2024）を明らかにしています。また、構造生物学の実験手法によって、Dofドメインの構造を解明し、Dof転写因子のユニークなDNA結合様式を明ら かにしました（Nat. Plants 11:836-848, 2025）。

関連する公表論文と総説

• Furihata H, Zhu Z, Nishida K, Sakuraba Y, Tsuji A, Yamashita H, Nosaki S, Tachibana R, Yamagami A, Ikeda Y, Abe M, Sawasaki T, Nakano T, Yanagisawa S, Tanokura M, Miyakawa T. (2025) Structural insights into CDF1 accumulation on the CONSTANS promoter via a plant-specific DNA-binding domain. Nat. Plants 11:836-848.
• Zhuo M, Sakuraba Y, Yanagisawa S. (2024) Dof1.7 and NIGT1 transcription factors mediate multilayered transcriptional regulation for different expression patterns of NITRATE TRANSPORTER2 genes under nitrogen deficiency stress. New Phytol. 242:2132-2147.
• Zhuo M, Sakuraba Y, Yanagisawa S. (2020) A jasmonate-activated MYC2–Dof2.1–MYC2 transcriptional loop promotes leaf senescence in Arabidopsis. Plant Cell 32:242-262.
• Konishi M, Yanagisawa S. (2015) Transcriptional repression caused by Dof5.8 is involved in proper vein network formation in Arabidopsis thaliana leaves. J. Plant Res. 128:643-652.
• Konishi, M., Donner, T., Scarpella, E., Yanagisawa, S. (2015) MONOPTEROS directly activates the auxin-inducible promoter of Dof5.8 transcription factor gene in Arabidopsis thaliana leaf provascular cells. J. Exp. Bot. 66: 283-291.
• Yanagisawa, S. (2015) Chapter 12: Structure and evolution of the plant Dof transcription factor family in Plant Transcription Factors: Evolutionary, Structural and Functional Aspects (Daniel H. Gonzalez, ed.), Elsevier/Academic Press, pp183-197.
• Negi, J., Moriwaki, K., Konishi, M., Yokoyama, R., Nakano, T., Kusumi, K., Hashimoto-Sugimoto, M., Schroeder, J.I., Nishitani, K., Yanagisawa, S., Iba, K. (2013) A Dof transcription factor, SCAP1, is essential for the development of functional stomata in Arabidopsis. Curr. Biol. 23: 479-484.
• Shigyo M, Tabei N, Yoneyama T, Yanagisawa S. (2007) Evolutional processes during the formation of the plant-specific Dof transcription factor family. Plant Cell Physiol. 48:179-185.
  
• Yanagisawa S. (2004) Dof domain proteins: Plant-specific transcription factors associated with diverse phenomena unique to plants. Plant Cell Physiol. 45: 386-391. [Abstract]
• Yanagisawa S. (2002) The Dof family of plant transcription factors. Trends Plant Sci. 7: 555-560. [Abstract]